个体户开具增值税专用发票，影响的是专票对应销售额的增值税免税待遇，不等于整个季度的免税资格自动取消。判断时要把“销售额是否达到免税标准”和“这笔销售是否开具专票”分开看。
专票部分如何处理
对适用小规模纳税人免税政策的个体户，按季度销售额未超过30万元的免税口径，开具增值税专用发票的销售额仍需按规定缴纳增值税；未开专票、且符合免税条件的其他销售额，仍可按规定享受免税。也就是说，不能因为总销售额在标准以内，就把专票部分一并按免税申报；也不应把“开过专票”理解成全季销售额都必须缴税。
申报时应核对发票类型、各类销售额及申报表中的免税和应税数据，确保专票对应金额没有误填进免税销售额。免税不代表无需申报，按期申报仍是必要义务。具体填报口径和适用政策，应以当期税务部门规定及电子税务局提示为准。
别把增值税和经营所得个税混为一谈
开专票直接影响的是增值税处理，不会因此自动改变经营所得个人所得税的计税规则。经营所得个税仍按经营所得申报；专票所对应的收入及相关成本费用，应纳入经营核算，最终影响的是应纳税所得额，而不是增值税免税额本身。
因此，决定开票前应先确认客户需要的发票类型，再核对该笔销售的税务处理和报价安排。若已开具专票，申报时不要只看季度总销售额是否低于免税标准，还要单独识别专票对应的应税销售额。